油棕(elaeisguineensis)中果皮发育过程中mirna的表达动态分析

？以ctab法提取油棕(elaeisguineensis)中果皮5个不同发育时期(g1~g5)的小rna。从前期研究获得的油棕小rna测序数据库中筛选12个候选mirna,实时荧光定量pcr法(qrt-pcr)检测其在果实发育过程中的表达量变化,并进一步对显著差异表达的mirna进行靶基因预测。结果表明:中果皮5个不同发育时期小rna的od260/od280比值在1.7~2.0之间;浓度分别是289、364、476、213、390ng/μl;qrt-pcr检测结果显示,12个候选mirna在5个发育时期均显著性差异表达,特别是在中果皮发育第4个时期(g4)和第5个时期(g5)表达量极显著增高,其中mir395和mir156在第4个时期表达量最高;mir395和mir528在发育第5时期表达量最高;靶基因预测结果显示差异表达的部分mirna,其靶基因可能参与了脂肪酸代谢通路,如磷脂酸磷酸脂酶和磷脂酶d。本研究筛选的与脂肪酸代谢相关的mirna为今后油棕脂肪酸代谢调控通路研究提供了可能的线索。