石油降解菌株g516srdna全序列的系统学分析

摘要用pcr方法扩增了一株石油降解菌株g5的16srrna基因全序列，并对其进行了克隆和测序.对该序列在genbank中的blast结果表明，所有与该序列高度同源的序列都是假单胞菌的16srrna基因.其中假单胞菌的代表菌株pseudomonasaeruginosa,p.fluoroscens,p.putida,p.syringae的16srrna基因序列与g5的16srrna基因序列同源性分别为93.4%,98.4%,96.3%,97.5%.对g5和其他39株假单胞菌的16srrna基因序列进行聚类分析，获得的系统发育树与rdp（ribosomaldatabaseproject）报道的系统发育树基本一致，其中菌株g5与5株p.chlororaphis聚类在一起.图2参7