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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用：99美元
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限制性显示技术作为一种高密度长链寡核苷酸芯片样本标记方法的初步研究
Keywords: 限制性显示技术,高密度长链寡核苷酸芯片,样本标记
Abstract:
目的初步研究限制性显示技术(rd-pcr)作为一种高密度长链寡核苷酸芯片样本标记方法对芯片杂交信号的影响。方法收集3个健康人外周血单核细胞,提取rna后分为两组,采用rd-pcr进行样本双色(cy3/cy5)荧光标记,与3张agilent60mer高密度(22k)人1b寡核苷酸芯片进行杂交。排除阴性和阳性对照信号值、cy3和(或)cy5的前景与背景间无统计显著性差异点的信号值,进一步排除两种荧光标记间存在统计显著性差异点的信号值,将3张芯片的共同信号值用于分析。spss软件进行常规统计分析和作图,r语言环境下的vsn统计包排除芯片间和两种不同荧光标记间的系统误差。结果3张芯片的8744个共同点用于本研究。芯片间及两种荧光标记间存在明显的可校正的系统误差。芯片间杂交信号值相关显著。rd-pcr样本标记方法对较低表达基因信号值较为敏感。结论初步的统计分析结果表明,rd-pcr是一种潜在的有用的高密度长链寡核苷酸芯片样本标记方法。
| [1] | kanemd,jatkoeta,stumpfcr,etal.assessmentofthesensitivityandspecificityofoligonucleotide(50mer)microarrays[j].nucleicacidsres,2000,28(22):4552-7.
|
| [2] | stearsrl,robertcg,stevenrg.anovel,sensitivedetectionsystemforhigh-densitymicroarraysusingdendrimertechnology[j].physiolgenomics,2000,3(2):93-9.
|
| [3] | guptav,cherkasskya,chatisp,etal.directlylabeledmrnaproduceshighlypreciseandunbiaseddifferentialgeneexpressiondata[j].nucleicacidsres,2003,31(4):13.
|
| [4] | 马文丽,郑文岭,jamesfb等限制性显示(rd-pcr):一种新的差异显示技术.见:孙志贤主编.全军生物化学与分子生物学研究进展[m].北京:军事医学科学出版社,1998.113-4.
|
| [5] | 郑文岭,马文丽,catervw.肿瘤细胞多聚腺苷酸聚合酶(pap)的差异表达显示.见:叶鑫生,沈倍奋,汤锡芳,等主编.细胞调控的探索[m].北京:军事医学出版社,199873-9.
|
| [6] | 马文丽,郑文岭,崔东,等.利用瓷片材料制备dna微集芯片[j].生物化学与生物物理学报,2000,32(3):285-9.mawl,zhengwl,cuid,etal.dnamicroarraychipsmadeonsurfaceofceramicslides[j].actabiochimbiophyssinica,2000,32(3):285-9.
|
| [7] | lil,mawl,zhuj,etal.preparationofhivgenechipprobesbyrd-pcrtechnology[j].chinjbiochemmolbiol,2001,18(5):105-9.
|
| [8] | lil,mawl,zhuj,etal.amodifiedrestrictiondisplaypcrmethodinsample-labelingofdnamicroarray[j].jvirolmethods,2003,114(1):71-5.
|
| [9] | 石嵘,马文丽,吴清华,等用于sars冠状病毒检测的60mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用[j]科学通报,2003,48(12):1237-41shir,mawl,wuqh,etal.designandapplicationof60meroligonucleotideprobesforsarsdetection[j].scibull,2003,48(12):1237-41.
|
| [10] | hughestr,maom,jonesar,etal.expressionprofilingusingmicroarraysfabricatedbyanink-jetoligonucleotidesynthesizer[j].natbiotechnol,2001,19(4):342-7.
|
| [11] | barczaka,rodriguezmw,hanspersk,etal.spottedlongoligonucleotidearraysforhumangeneexpressionanalysis[j].genomeres,2003,13(6):1775-85.
|
| [12] | nadonrandshoemakerj.statisticalissueswithmicroarrays:processingandanalysis[j].trendsgenet,2002,18(5):265-71.
|
| [13] | churchillga.fundamentalsofexperimentaldesignforcdnamicroarrays[j].natgenet,2002,32(suppl):490-5.
|
| [14] | gelderrnv,vonzastrowme,yoola,etal.amplifiedrnasynthesizedfromlimitedquantitiesofheterogenouscdna[j].procnatlacadsci,1990,87(5):1663-7.
|
| [15] | richtera,schwagerc,hentzes,etal.comparisonoffluorescenttagdnalabelingmethodsusedforexpressionanalysisbydnamicroarrays[j].biotechniques,2002,33(3):620-8,630.
|
| [16] | badieea,eikenhg,steenvm,etal.evaluationoffivedifferentcdnalabelingmethodsformicroarraysusingspikecontrols[j].bmcbiotechnol,2003,3(1):23.
|
| [17] | ’thoenpac,kortdef,ommenvangjb,etal.fluorescentlabelingofcrnaformicroarrayapplications[j].nucleicacidsres,2003(5),31.
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