广东流行的三株登革1型病毒包膜蛋白基因的序列测定与分析

目的通过对广东省不同地区、不同流行期间分离的三株登革1型病毒(dv1)的结构蛋白e基因进行序列测定及分析,了解各流行株之间的遗传差异,追踪其可能的传染来源。方法应用rt-pcr技术扩增病毒的结构蛋白e基因,克隆到pmd18-t载体,转化jm109宿主菌,挑取阳性克隆进行鉴定及序列测定,应用计算机软件与国内外参考及流行株进行同源性分析,并绘制基因系统发生树。结果3株dv1病毒e基因序列长度均为1485bp,编码495个氨基酸,核苷酸序列同源性在91%~98%之间,推测的氨基酸序列同源性在94%~99%之间。gd23/95与a88核苷酸(氨基酸)同源性为95%(98%),与其他株的同源性相对较低,2株属同一基因型;gd14/97和gd05/99与cambodia共享序列非常接近,3株同属另一基因型。结论广东省1997、1999和1995年流行的登革热可能来自境外不同的疫源地。