鸡新城疫病毒分离株f基因的分子特性分析

[目的]对新城疫病毒(ndv)分离毒株进行分子特征分析,了解免疫鸡群发生新城疫的原因.[方法]用非免疫鸡胚从病鸡肺脏中分离新城疫病毒;参考genbank上发表的ndv的f基因序列设计引物,应用rt-pcr方法对新城疫病毒分离株进行扩增,并构建克隆载体,对阳性质粒测序后进行f基因核苷酸及推导氨基酸序列分析.[结果]从发病鸡群中分离到6株ndv,分离毒株间的f基因核苷酸和f蛋白氨基酸同源性分别在99.6%～99.9%和99.1%～99.8%;分离毒株与参考毒株的f基因核苷酸和f蛋白氨基酸序列同源性分别在83.2%～87.3%和90.2%～93.8%;分离毒株f蛋白裂解位点的氨基酸顺序为112r-r-qk-r-f117,符合强毒株的分子特征;6个分离株均属ndv基因ⅶ型.[结论]ndv分离株的f基因已经发生明显变异,与lasota、clone-30、v4等常用疫苗株在遗传进化上的亲缘关系较远,这可能是免疫鸡群发生新城疫的重要原因之一.