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ISSN: 2333-9721
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草鱼抗病毒基因mx全长cdna的克隆、序列分析与真核表达载体构建

, PP. 502-508

Keywords: 草鱼,mx基因,克隆,序列分析,载体构建

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Abstract:

mx蛋白是一类由i型干扰素(ifn)诱导表达的抗病毒蛋白。以polyi∶c诱导的草鱼(ctenopharyngodonindellus)肾细胞(cikcells)为材料,抽提细胞总rna,通过rtpcr的方法扩增出〖wtbx〗mx〖wtbz〗基因cdna全序列,连接至pmd20t载体上,构建重组质粒pmd20tmx,并测序进行序列分析。用限制性内切酶从克隆的重组质粒pmd20tmx上切下mx基因,插入到质粒pegfpc1中,构建真核表达载体pegfpc1-mx。结果显示,该基因cdna全序列为1921bp,阅读框共编码627个氨基酸,分子量约为71.1ku,理论等电点pi为8.33,其编码的mx蛋白具有脊椎动物mx蛋白共有的结构特征:一个三联体gtp结合区域和一个发动蛋白家族的典型结构特征序列。生物信息学分析表明,草鱼mx基因所编码的蛋白质以亲水区域为主,具有丰富的b细胞抗原位点,但无明显的核定位序列,空间结构包括n端的gtp酶结构域(gtpasedomain)、中间的中央相互作用结构域(centralinteractivedomain,cid)和c端的gtp酶效应结构域(gtpaseeffectordomain,ged)。同源性分析显示,草鱼mx蛋白氨基酸序列和其他物种的相似性为45.1%〖kg-*4〗~99.7%。此外还成功构建了含草鱼mx基因cdna全序列的真核表达载体pegfp-c1-mx。

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