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ISSN: 2333-9721
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辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶基因(badh)启动子分离及序列分析

Keywords: 辽宁碱蓬,甜菜碱醛脱氢酶,启动子,序列分析

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Abstract:

根据已知的辽宁碱蓬badhcdna5′端序列设计两个基因特异的反向引物(br1,br2),通过衔接头pcr获得了badh基因起始密码子上游265bp的序列。根据所获得的序列设计两个基因特异的反向引物(br3,br4),用br2、br3、br4分别与4个简并引物配对,通过tailpcr扩增,获得了约2kb的序列。经sequencer软件拼接上述两段序列,获得了badh基因起始密码子上游2055bp的序列。用tssptcm软件分析此序列,预测出转录起始点(t)位于起始密码子上游62bp处,由此获得了1993bp的slbadh启动子序列。用place软件分析此序列,发现该序列具有启动子的基本元件tatabox、caatbox,包含多个胁迫诱导元件,如盐诱导元件gaaaaa,抗冻、缺水、脱落酸、抗寒元件canntg,伤害诱导元件anattncnn,热激元件ataaatgt等,是一个强的胁迫诱导启动子。

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