鲤头长、体厚、体高性状的qtl定位及遗传效应分析

用174个ssr、41个est、345个snp标记对以镜鲤良种后代为祖父母本所培育的杂交f2群体的68个个体进行基因型检测,运用joinmap4.0软件包构建遗传连锁图。利用mapqtl5.0区间作图法(intervalmapping,im)和多qtl区间定位法(mqmmapping,mqm)进行qtl检测,通过置换实验(1000次重复)确定连锁群显著性水平阈值。在对体高、头长、体厚的区间定位中,共检测到6个与体高性状相关的qtls区间,分布在lg1(snp1339-snp1490)、lg10(hlje469-snp1491)、lg12(snp0922-hlj1316)、lg13(snp0937-hlj328)、lg25(snp1041-hlj594)、lg35(snp1425-snp0389)等6个连锁群上,解释表型变异范围为20.0%～43.3%。其中,snp1339-snp1490区间lod值最大为3.64,解释表型变异35.4%。6个与头长相关的qtls,分布在lg1(snp1339-snp1490)、lg12(hlj071-hlj336)、lg13(snp0937-hlj328)、lg24(snp1359-snp0586)、lg24(snp1016-snp0326)、lg25(hlj382-hlj348)等5个连锁群上,其中lg24(snp1359-snp0586)解释表型变异达到50.2%。检测到10个与体厚相关的qtls,分布在lg1、lg8、lg9、lg10、lg12、lg34、lg35、lg38、lg41等9个连锁群上,解释表型变异范围是16.1%～68.8%,其中lg38(hlj1331-hlj487)和lg41(hlj688-hlje6)解释表型变异分别达到60.8%和68.8%,是体厚性状的主效qtls区间。