中华鳖3个地理群体线粒体基因d-loop区遗传多样性分析

采用pcr结合dna测序技术和sscp技术,分析了中华鳖3个地理群体线粒体dna(mtdna)d-loop区部分序列的变异及遗传多样性。在25个个体中,其碱基组成为at的平均含量(65.4%)高于gc(34.6%),共检测到变异位点7个(约占总位点数的5.7%),转换/颠换值为2.76。核苷酸多样性(π)为0.01995,平均核苷酸差异数(k)为2.453。25个个体分属6个单倍型,单倍型多样度(hd)为0.707,单倍型间的平均遗传距离(p)为0.027。6个单倍型构建的upgma系统树聚为3个分支。结果表明,中华鳖群体mtdnad-loop区序列存在着较丰富的变异和遗传多样性,日本鳖的遗传多样性比黄河鳖和黄沙鳖丰富,黄沙鳖与日本鳖、黄河鳖的遗传距离较远。而且pcr-sscp可以检测到两种类型的电泳图谱,其中ⅱ型均为日本鳖,该技术可用于78位tt-aa颠换变异位点的检测。