哲罗鱼免疫球蛋白轻链可变区序列及其多样性

采用rt-pcr技术从哲罗鱼主要免疫器官脾脏总rna中获得免疫球蛋白（immunoglobulin,ig）轻链可变区cdna克隆，随机挑取51个阳性克隆菌落进行测序，得到46条完整的不重复序列，用以确定哲罗鱼igl的家族种类，为哲罗鱼病毒性疾病的疫苗研制提供理论依据。经过blust网络对比，结果显示：其与genbank报导的虹鳟（序列号为x68517.1和x68519.1）序列的相似性均达90%以上，46条序列的核苷酸相同率分别为最低86.1%(p4与p43)至最高的99.8%(p21与p38)之间不等；经dnastar5.0软件包megaling中jotunhein方法对所得序列进行氨基酸同源性比较，得到两个不同的家族；通过可变性参数计算方法可知哲罗鱼igl的可变性主要集中在cdrs区，可变性最高的区域为cdr3区；对可变区中cdr3序列进行分析后，得出哲罗鱼ig轻链可变区的重排方式是jκ基因片段位于vκ基因片段的3′端的结论，这种重排方式增加了核苷酸不同的连接方式，使哲罗鱼抗体具有更多的可变性空间；对照其亲水性分布图可知：可变区的亲水性氨基酸主要分布于lp前端，fr1末端，完整的fr2，fr3两端，以及cdr1，cdr2和cdr3前端。