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水产学报 2009
大菱鲆脾脏cdna文库构建、est序列分析与免疫抗病相关基因的筛选DOI: 10.3724/SP.J.00001, PP. 713-718 Keywords: 大菱鲆,cdna文库,表达序列标签,免疫相关基因 Abstract: 以大菱鲆脾脏为材料,构建cdna文库,通过对文库克隆的序列测定和初步生物信息学分析,共获得3656个大菱鲆脾脏表达序列标签(est)。经与genbank数据库的序列比对后发现,1891个est代表了149个已知基因,其余1765个est为未知序列。这149个基因大致可分为6类:9个为细胞结构类(6.0%);26个为代谢类(17.5%);45个为细胞防御/免疫类(30.2%);43个为基因/蛋白质表达类(28.9%);16个为细胞信号转导/细胞交流类(10.7%);10个无法明确分类(6.7%)。鉴定的与免疫抗病相关重要基因主要有:cc/cxc趋化因子;主要组织相容性复合体(mhc)classiα;c3补体;天然杀伤细胞增强因子(nkef);胸腺素β-4/β-12;干扰素诱导蛋白gig1;白介素8受体;stat4;热激蛋白70/90等。
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