栉孔扇贝消化盲囊细菌群落组成的季节变化分析

为分析栉孔扇贝消化盲囊内细菌群落组成及其季节变化,于2009年6月—2010年6月(2月份除外)定期从青岛沙子口流清河湾扇贝养殖海区采集养殖的2龄栉孔扇贝,采用sds方法提取消化盲囊的总dna,并通过引物358f和907r采用pcr扩增细菌16srdna的v3～v5区序列,利用变性梯度凝胶电泳(denaturinggradientgelelectrophoresis,dgge)分离所得扩增序列。dgge图谱显示,12个月份的样品共有不同位置的谱带11条,其中9条谱带作为共有谱带在所有月份的栉孔扇贝消化盲囊中均有分布,占总谱带数的81.82%,表明整个养殖季节栉孔扇贝消化盲囊内的细菌群落组成相对稳定。对11条dgge条带进行切胶回收、pcr扩增、纯化、克隆后测序,其中9条谱带克隆测序成功。经blast比对搜索,结果显示9条序列与ncbi数据库中的序列相似性达97%～99%,所代表的细菌分别属于4大类群,变形菌门(proteobacteria)、厚壁菌门(firmicutes)、蓝细菌门(cyanobacteria)和放线菌门(actinobacteria);ncbi数据库中与其相近的细菌主要为马赛菌属(massilia)、芽孢杆菌属(bacillus)、微小杆菌属(exiguobacterium)、聚球藻属(synechococcus)、红球菌属(rhodococcus)和未培养菌。