|
生态学报 2012
链状亚历山大藻生长衰亡相关基因的筛选Abstract: 采用抑制性消减杂交(suppressionsubtractivehybridization,ssh)技术构建了衰亡期的链状亚历山大藻(alexandriumcatenella)特异表达的cdna文库。共获得800个克隆,利用巢式引物进行pcr筛选,最终确定阳性克隆556个。利用斑点杂交技术对这些阳性克隆进行差异筛选,获得差异表达克隆160个。测序后得到片段125个,经过归类,获得21种序列,其中6种在ncbi中经blast,获得功能基因与其匹配,这些功能基因分别是chk1类似检测点蛋白(checkpoint-likeprotein)、核酸外切酶复合体、谷氧还蛋白、na+/k+atpase、叶绿体中的一个开放阅读框和pg1蛋白,其他blast无同源序列,可能为新基因。推测链状亚历山大藻的衰亡过程可能涉及到dna损伤、mrna降解过程、氧化还原状态的变化、离子动态平衡的变化以及叶绿体一些生理状况的变化等过程。
|