基因组原位杂交鉴定牛筋草aa基因组在穇子染色体上的分布及探针长度优化方法

采用基因组原位杂交(genomicinsituhybridization,gish)方法研究了牛筋草(eleusineindica)aa基因组在穇子(e.coracana)染色体上的分布,并探讨了aa、bb基因组的同源关系。用超声波破碎法进行预剪切,以缺口平移法标记的牛筋草总dna为探针,bb基因组的e.floccifolia(forssk.)spreng.总dna为封阻,与aabb基因组穇子的中期染色体进行杂交。结果表明,牛筋草aa基因组分布在穇子的18条染色体上。不加封阻或加过量封阻均不能鉴别aa基因组,说明aa和bb基因组间的分化程度不大,双方共享的重复序列较多。牛筋草与e.floccifolia总dna分别用超声波破碎2min和3min后,可得到峰值为300~750bp的dna片段,这说明不同物种的超声波破碎时间需要调整,以获得合适长度的探针。