丹参erf基因组序列克隆与多态性分析

乙烯应答因子结合蛋白(ethyleneresponsivefactorbindingprotein,erf)属于ap2/erf转录因子超？家族中的erf家族,是植物所特有的一类转录因子,在植物生长、发育以及应对各种环境刺激等方面均发挥重要的作用。本文从丹参中克隆得到一个丹参smerf基因,该基因属于拟南芥和水稻erf家族中的vii组,含有cmvii-1的蛋白模体,序列为mcggai(i/l),且在ap2/erf功能域的5'端含有一个内含子。通过对丹参主产区山东、陕西、四川181个样本的检测,发现smerf第二外显子区域存在大量的变异位点,264bp范围内共存？？？？在21个单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,snp),有14个为非同义突变,7个为同义突变。不同产地样品具有产地特异的基因型,其中有5个位点在不同产地间均表现出显著差异,聚类分析表明smerf基因可按产地聚类。该结果显示smerf基因有望作为丹参产地鉴别的标识基因,并为smerf基因功能的确定奠定了基础。