基于aox基因探讨隐孢子虫分离株种系发育关系

？本实验以线粒体功能性蛋白基因alternativeoxidase（aox）作为研究对象，对隐孢子虫分离株进行扩增测序，用clustalx1.81对扩增的序列与genbank下载的相关序列进行比对，用paup4.0程序中邻接法（neighbor-joiningmethod，nj）、最大简约法（parsimony,mp）建树，同时用puzzle程序version4.1构建最大似然树（maximumlikelihood,ml），以确定不同隐孢子虫分离株之间的进化关系，并与18srrna和hsp70基因构建的进化树作参照，进而评价aox这一基因序列是否适合作为隐孢子虫基因分型和进化关系分析的基因座。结果：通过aox构建的进化树将隐孢子虫分为两大类：c.baileyi和c.meleagridis关系更为密切两者处于一个分枝，c.hominis、c.suis、c.parvum牛基因型和c.parvum鼠基因型处于另一个分枝上。不同隐孢子虫之间的同源性介于91.8％～99.6％，能有效区分隐孢子虫不同基因型。因此，aox基因序列也可作为隐孢子虫分离株种系发育的遗传标记。