甘蔗富含甘氨酸蛋白基因(sc-grp)的克隆及其表达分析

？本研究在对甘蔗(saccharumofficinarum)叶片全长cdna文库测序的基础上，通过est(expressedsequencetag)序列测定和生物信息学分析，获得了1个编码富含甘氨酸蛋白(glycine-richprotein,grp)基因的全长cdna序列，命名为sc-grp。生物信息学分析表明，该基因全长518bp，包含一个273bp的完整开放阅读框(openreadingframe,orf)，5'端非编码区(untranslatedregion,utr)长58bp，3'端utr长187bp，且在3'端utr中有典型的加尾信号aataaa和polya结构。该基因编码长度为90个氨基酸的蛋白，其理论分子量为10.12kd，等电点为5.86。sc-grp中甘氨酸含量最高，达到13%，且包含明显的ggx和gx重复结构单元。sc-grp没有信号肽和rna结合位点。定量pcr分析结果表明，该基因在成熟叶片中的表达量远高于其在心叶中的表达量。在甘蔗茎中，随着节间成熟度的增加，其表达量逐渐升高，但在成熟根中几乎没有表达。在铝盐胁迫下，该基因在甘蔗初生根中的表达先是升高，然后随胁迫时间的增加而下降。研究结果提示该基因定位于细胞质，参与细胞的渗透调节，本研究为该基因的功能解析及其在甘蔗分子育种上的应用积累了基础资料。