山羊瘤胃微生物基因组dna提取方法比较

？为了获得高质量的山羊(caprahircus)瘤胃微生物基因组dna，用于分析瘤胃微生物多样性，本研究采用珠磨+tris-饱和酚法、珠磨+十二烷基磺酸钠(sodiumdodecylsulfate,sds)法、珠磨+sds/异硫氰酸胍(guanidinethiocyanate,gitc)法、珠磨+sds/醋酸铵(nh4ac)法、珠磨+sds/gitc/nh4ac法和sds/gitc法等6种dna提取法提取山羊瘤胃微生物基因组dna。通过dna浓度和纯度的测定、聚合酶链式反应(polymerasechainreaction,pcr)、变性梯度凝胶电泳技术(denaturinggradientgelelectrophoresis,dgge)对提取效果进行比较，以找到适合于山羊瘤胃微生物基因组dna的提取方法。结果表明，应用珠磨+sds/gitc/nh4ac法提取的瘤胃微生物基因组dna纯度较好，浓度高达96.4ng/μl，并可同时扩增出瘤胃细菌和产甲烷古菌的16srdna片段，且细菌和产甲烷古菌的多样性指数均最高，更适合于瘤胃微生物菌群后续分子生物学研究。