猪流行性腹泻病毒s、n和orf3基因的遗传变异分析

？为探明2012—2013年在福建省流行猪流行性腹泻病毒（pedv）结构蛋白的遗传变异情况，对7株pedv流行毒株的s、n及orf3基因进行克隆、测序及分析。结果表明：7株pedvs基因之间的核苷酸相似性为98.6％～99.4％，与attenuateddr13弱毒株和cv777标准株的相似性分别为93.7％～94.1％和93.8％～94.1％；同cv777标准株比较，存在64个氨基酸突变，其中有3个氨基酸较以往国内外流行毒株的变异不一样，为新变异氨基酸，氨基酸的插入和缺失与2008年泰国npped2008_2株相似；7株pedv毒株的n基因和orf3基因之间核苷酸的相似性分别为96.5％～99.7％和99.7％～100％，与cv777标准株的相似性分别为96.6％～98.0％和96.6％～96.9％。遗传进化树表明：7株pedv毒株的s基因和orf3基因与泰国流行毒株的亲缘关系较近，n基因与cv777标准株亲缘关系较近。7株pedv毒株的s基因和orf3基因变异程度较大，可能源于泰国及韩国的变异株。