鳗鲡病原性气单胞菌外膜蛋白基因全长的克隆与抗原决定簇分析

为寻找存在于鳗鲡病原性气单胞菌间的共同外膜蛋白保护性抗原。通过NCBI/GenBank数据库检索，找出气单胞菌多种外膜蛋白的序列信息，经比对后找到一条高度保守的基因序列片段。据相应片段从嗜水气单胞菌（Aeromonashydrophila）和杀鲑气单胞胞菌（A.salmonicida）的全基因组序列中钓出Ⅱ型孔蛋白基因的全长序列及该基因区域之外两端的序列。根据嗜水气单胞菌和杀鲑气单胞胞菌这两端序列的保守区域设计一对特异性引物，用该引物扩增到鳗鱼病原库30株气单胞菌中11株菌的Ⅱ型孔蛋白基因全长，经测序后获得10株菌的Ⅱ型孔蛋白基因全长序列。选择遗传距离居中菌株，对该基因推导的表达产物进行蛋白结构预测、亲水性和抗原决定簇分析后发现，这些蛋白均具有三级结构，亲水性强且具有丰富的抗原决定簇。不同菌株的多个抗原决定簇经比对分析后，寻找到存在于多株鳗鲡病原性气单胞菌间的6个保守抗原决定簇。为养殖鳗鲡病原菌外膜蛋白共同保护性抗原的基因工程疫苗研究奠定了理论基础。