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地质学报 2010
西太平洋深海沉积物古菌多样性分析, PP. 1105-1111 Abstract: 以提取并纯化的西太平洋深海沉积物DNA为模板,利用古菌PCR特异性引物扩增出样品中古菌的16SrDNA片段,构建其克隆文库,建立阳性克隆子RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymor-phism)酶切图谱。据酶切图谱对所获得的90个克隆进行测序,并与数据库中的序列进行比对,从而进行古菌的多样性和系统发育分析。结果表明,沉积物中扩增的16SrDNA古菌序列分别来自泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota),以MarineBenthicGroupB(11.8%)、MarineBenthicGroupD(13.6%)、MarineCrenarchaeoticGroup(68.69%)为主。少量序列为SouthAfricanGoldMineEuryarchaeoticGroup(1.07%)、Deep-SeaHydrothermalVentEuryarchaeoticGroup(1.61%)、UIIB(1.25%)、VALIII(1.79%)、MarineBenthicGroupE(0.18%)。以上结果表明西太平洋深海沉积物中有丰富多样的古菌群落。
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