OALib Journal期刊
基于SSR标记的短季棉品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析
DOI: 10.7668/hbnxb.2014.04.016
Keywords: 短季棉 ,SSR ,指纹图谱 ,遗传多样性
Abstract:
为解决长江流域缺乏适合短季棉材料分子分析的SSR引物问题及加强对引进短季棉材料遗传信息的了解，以从中国农业科学院棉花研究所引进的15份短季棉品种为材料，利用SSR标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。结果表明，从214对候选SSR引物中筛选出稳定性好、多态性高、基本覆盖棉花26条染色体的68对引物，对15份材料的基因组DNA进行了PCR扩增，共检测出178个有效等位位点，平均每对引物检测到2.62个；引物多态性信息含量（PIC）值介于0.2449～0.9061，平均0.6938。品种指纹分析结果显示，在15份材料中，12份材料可采用特征引物进行一次性区分，其他材料需采用引物组合来实现与其他品种的区分，利用4对引物组合共检测出21个多态性条带，平均每对引物检测出5.25个，构建了15份材料的指纹图谱。利用NTSYS-pc2.1软件聚类分析表明：材料基因型间遗传相似系数为0.45~0.79，平均为0.62，在相似系数0.68处可将材料分为5大类，结合系谱对聚类情况进行了系统分析，研究结果为短季棉资源鉴定和利用提供了依据。
References
[1] 武文,邓启云,周丽洁,等.利用SSR 分子标记构建Y58S及部分重要两系杂交水稻亲本的DNA指纹图谱[J].杂交水稻,2008,23(3):52-56. [2] 张建华,张金渝,杨晓洪,等.用SSR 标记建立玉米黄早四DNA标准指纹图谱的方法研究[J].西南农业学报,2006,19(3):345-350. [3] 王通强,马晓峰,吴有祥.油菜杂种及亲本指纹图谱构建和杂种纯度鉴定[J].食品与生物技术学报,2009,28(3):377-384. [4] 段艳凤,刘杰,卞春松,等.中国 88 个马铃薯审定品种 SSR 指纹图谱构建与遗传多样性分析[J].作物学报,2009,35(8):1451-1457. [5] 李育强,陈浩东,洪亚辉,等.湘杂棉SSR 指纹图谱的构建及应用[J].棉花学报,2009,21(3):175-178. [6] 匡猛,杨伟华,许红霞,等.中国棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及SSR标记遗传多样性分析[J].中国农业科学,2011,44(1):20-27. [7] 郭旺珍,张天真,潘家驹,等.我国棉花主栽品种的RAPD 指纹图谱研究[J].农业生物技术学报,1996,4(2):129-134. [8] 陈浩东,刘方,王为,等.棉花多重PCR 技术及其对杂交棉纯度鉴定的初步研究[J].棉花学报,2011,23(1):22-27. [9] 张艳欣,林忠旭,李武,等.海岛棉EST-SSR 引物的开发与应用研究[J].科学通报,2007,52(15):1779-1787. [10] Chen G,Du X M.Genetic diversity of source germplasm of upland cotton in China as determined by SSR marker analysis[J].Acta Genetica Sinica,2006,33(8):733-745. [11] 周忠丽,杜雄明,潘兆娥,等.亚洲棉种质资源的SSR遗传多样性分析[J].棉花学报,2013,25(3):217-226. [12] 李成奇,王晓芸,刘莹,等.百棉3号、百棉018杂交种及其亲本SSR指纹图谱构建[J].河南农业科学,2011,40(6):56-59. [13] 韩宗福,赵逢涛,王景会,等.鲁棉研系列抗虫棉品种SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析[J].华北农学报,2013,28(增刊):1-6. [14] 孙东磊,孙君灵,杜雄明,等.棕色棉与绿色棉遗传多样性比较研究[J].华北农学报,2009,24(5):96-101. [15] 武耀廷,张天真,殷剑美.利用分子标记和形态学性状检测的陆地棉栽培品种遗传多样性[J].遗传学报,2001,28(11):1040-1050. [16] 喻树迅,黄祯茂.短季棉品种早熟性构成因素的遗传分析[J].中国农业科学,1990,23(6):48-54. [17] 陈仲方,张治伟,王支凤.陆地棉品种早熟性研究[J].江苏农业学报,1989,5(3):12-19. [18] 薛艳,张新宇,沙红,等.新疆早熟棉品种SSR指纹图谱构建与品种鉴别[J].棉花学报,2010,(22)4:360-366. [19] 姚全胜,詹儒林,黄丽芳,等.11个芒果品种SSR 指纹图谱的构建与品种鉴别[J].热带作物学报,2009,30(11):1572-1576. [20] Tatineni V,Cantrell R G,Davis D D.Genetic diversity in elite cotton germplasm determined by morphological characteristics and RAPDs[J].Crop Science,1996,36:186-192. [21] 于霁雯.短季棉遗传多样性分析及其重要农艺和经济性状的QTL定位[D].武汉:华中农业大学,2006. [22] 王心宇,郭旺珍,张天真,等.我国短季棉品种的RAPD指纹图谱分析[J].作物学报,1997,23(6):669-676. [23] 张玉翠,杨伟华,匡猛,等.32个棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析[J].棉花学报,2012,24(2):120-126. [24] 韩宗福,王景会,申贵芳,等.黄河流域棉花主要品种SSR指纹图谱构建及遗传差异分析[J].棉花学报,2011,23(6):545-551. [25] 李成奇,王晓芸,张晓飞,等.百棉系列棉花自交系品种(系)SSR指纹图谱构建[J].棉花学报,2011,23(3):228-234. [26] 孙宁,杨付新,付小琼,等.国家棉花区试新品种的SSR指纹图谱分析[J].棉花学报,2011,23(3):279-283.
Full-Text
Contact Us
service@oalib.com
QQ:3279437679
WhatsApp +8615387084133
