轮状病毒非结构蛋白1与种属限制性的相关性研究

目的研究轮状病毒（rotavirus,RV）非结构蛋白1(nonstructuralprotein1,NSP1)与种属限制性的相关性，探讨NSP1在RV种属限制性机制中的作用。方法对UniProt数据库中的RVNSP1C末端、全序列以及GenBank数据库中NSP1基因的3′端非编码序列利用DNAStar(Lasergene)7.1软件进行种属间和种属内的序列比对和进化树分析。结果NSP1种属间的多样性与RV宿主特异性一致，NSP1的C末端、NSP1基因3′端非编码序列与NSP1全序列种属内的一致性较高，且高于种属间一致性(P<0.01)。结论NSP1与RV种属限制性密切相关。NSP1与宿主特异的干扰素调节因子3（interferonregulatoryfactor3,IRF3）相结合的特性和RV的种属限制性相关，其结合区域可能是决定RV种属限制性的关键区域。NSP1基因3′端非编码序列可能在基因水平参与调控RV种属限制性。