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ISSN: 2333-9721
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Oligo基因芯片筛选视网膜慢性高眼压损伤差异表达基因的初步数据分析

, PP. 1333-1337

Keywords: 基因芯片,视网膜,慢性高眼压,数据分析

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Abstract:

目的采用35000点的高密度Oligo基因芯片对大鼠慢性高眼压导致视网膜损害的6个时间点(7、35、60、90、180、360d)的基因表达情况加以研究,探讨慢性高眼压影响下视网膜基因表达改变的情况。方法将基因分成“活动”基因和“差异”基因:在“活动”基因中,要求6个时间点中最大Ratio值/最小Ratio值的比值大于2。将差异基因再分为高、低表达及过表达基因,每一类基因按照其生物学功能进行功能检索、分组。对与轴突生长、导向、突触形成相关基因的功能进行初步探讨。结果差异表达基因1692个:高表达的基因719个(Ratio≥2),包括6个过表达基因(Ratio≥7);低表达的基因973个(Ratio≤0.5)。719个高表达基因中,功能完全未知者占54%,其余功能已知或部分已知者共分为14组,在损伤过程中所占比例最大的是代谢和物质转运组。轴突生长、导向及突触形成相关的基因,抑制轴突生长的基因及神经元的迁移、轴突的生长相关基因在损伤过程中均有呈高表达。结论建立了大鼠慢性高眼压损伤视网膜差异基因表达库,差异表达基因在慢性高眼压视网膜损害中可能有重要的意义。

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