新疆草兔的种群遗传结构和亚种分化

新疆草兔(Lepuscapensis)的群体遗传结构至今无系统的研究报道,亚种水平的分类也长期存在争议。该文测定了形态分类上的新疆草兔3个亚种共87个个体的线粒体DNA(mtDNA)控制区(controlregion,D-Loop)592bp的序列,经分析发现148个多态性位点,共定义了44个单倍型。新疆草兔的单倍型多样度(h，0.977±0.005)和核苷酸多样度(π，0.064±0.031)都较高,显示了较高的遗传多样性。分子变异分析(AMOVA)结果显示,4个地理群体间的显著分化可能是由地理隔离造成的。群体遗传结构分析显示,新疆草兔包含4个进化枝,并且每个进化枝都对应特定的分布区域,显示了明显的系统地理结构。该研究的结果支持形态分类上草兔西域亚种(L.c.lehmanni)的分类地位;但中亚亚种(L.c.centrasiaticus)被分为两个独立的进化枝,提示可能存在两个亚种;帕米尔亚种(L.c.pamirensis)与其他亚种间的遗传距离在13%以上,提示其可能已达到种的分化水平。