全部 标题 作者
关键词 摘要

OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用:99美元

查看量下载量

相关文章

更多...
草业学报  2013 

发生马铃薯立枯病土壤中立枯丝核菌的荧光定量PCR快速检测

DOI: 10.11686/cyxb20130516, PP. 136-144

Keywords: 连作马铃薯根际土壤,立枯丝核菌,实时荧光定量PCR,动态变化趋势

Full-Text   Cite this paper   Add to My Lib

Abstract:

连作马铃薯根际土壤中立枯丝核菌的大量累积可能是导致马铃薯连作障碍发生的主要原因之一。为了解根际土壤中土传病害病原菌的积累与连作障碍之间的关系,进一步寻求缓解和克服马铃薯连作障碍土传病害的有效途径,本研究建立优化了荧光定量PCR(real-timePCR)方法,对引起马铃薯立枯病的病原菌立枯丝核菌进行了快速监测和绝对定量,对马铃薯连作1~5年根际土壤立枯丝核菌的动态变化趋势进行了检测分析。结果显示,研究建立优化的荧光定量PCR检测方法,可直接应用土壤DNA进行病原菌的定量检测,能检测到土壤中浓度为1×102个拷贝/g土的马铃薯立枯丝核菌,扩增效率为1.04,具有检出限低、扩增效率高的特点,实现了不通过病土分离培养方法,就可掌握病原菌在根际土壤中的累积状况;在马铃薯立枯病发病严重的连作根际土壤中,立枯丝核菌的累积数量随连作年限的递增呈上升趋势;病原菌的累积随生育进程的推进呈下降趋势;病原菌累积量最大的是连作5年的播前土壤,每g土壤达3.75×107个拷贝数,由此可见,连作导致了土壤微生物种群结构发生改变,土壤致病真菌数量增加,相应地也增加了马铃薯立枯病的初侵染机率。

References

[1]  于品华. 饲用型马铃薯新品系“杂3单选-5”选育研究. 草业学报, 2004, 13(2): 115-117.
[2]  张茹, 李金花, 柴兆祥, 等. 基因的克隆及转基因马铃薯植株的获得.草业学报, 2009, 18(6): 51-58. 浏览
[3]  刘宝玉, 胡俊, 蒙美莲, 等. 马铃薯黑痣病病原菌分子鉴定及其生物学特性. 植物保护学报, 2011, 38(4):379-380.
[4]  刘秉义, 董风林, 靳军良, 等. 固原市马铃薯连作减产原因分析及应采取的措施. 中国马铃薯, 2009, 23(5):303-304.
[5]  谭宗九, 郝淑芝. 马铃薯丝核菌溃疡病及其防治.中国马铃薯, 2007, 21(2): 108-109.
[6]  姚文国, 崔茂森. 马铃薯有害生物及其检疫. 北京:中国农业出版社, 2001: 1-15.
[7]  田晓燕, 蒙美莲, 张笑宇, 等. 马铃薯黑痣病病菌菌丝融合群的鉴定. 中国马铃薯, 2011, 25(5): 298-301.
[8]  孟品品, 刘星, 邱慧珍, 等. 连作马铃薯根际土壤真菌种群结构及其生物效应. 应用生态学报, 2012, 23(11): 3079-3086.
[9]  苏世鸣, 任丽轩, 霍振华, 等. 西瓜与旱作水稻间作改善西瓜连作障碍及对土壤微生物区系的影响. 中国农业科学, 2008, 41(3): 704-712.
[10]  胡元森, 吴坤, 李翠香, 等. 黄瓜连作对土壤微生物区系影响-基于DGGE方法对微生物种群的变化分析. 中国农业科学, 2007, 40(10): 2267-2273.
[11]  吴凤芝, 王学征. 设施黄瓜连作和轮作中土壤微生物群落多样性的变化及其与产量品质的关系. 中国农业科学, 2007, 40(10): 2274-2280.
[12]  李坤, 郭修武, 孙英妮, 等. 葡萄连作对土壤细菌和真菌种群的影响. 应用生态学报, 2009, 20(12): 3109-3114.
[13]  张树生, 杨兴明, 茆泽圣, 等. 连作土灭菌对黄瓜生长和土壤微生物区系的影响. 生态学报, 2007, 27(5): 1809-1817.
[14]  邹莉, 袁晓颖, 李玲, 等. 连作对大豆根部土壤微生物的影响研究. 微生物学杂志, 2005, 25(2): 27-30.
[15]  陈慧, 郝慧荣, 熊君, 等. 地黄连作对根际微生物区系及土壤酶活性的影响. 应用生态学报, 2007, 18(12): 2755-2759.
[16]  张重义, 尹文佳, 李娟, 等. 地黄连作的生理生态特性. 植物生态学报, 2010, 34(5): 547-554.
[17]  阮维斌, 王敬国, 张福锁, 等. 根际微生态理论在连作障碍中的应用. 中国农业科技导报, 1999, 1(4): 53-58.
[18]  阮维斌, 王敬国, 张福锁, 等. 连作障碍因素对大豆养分吸收和固氮作用的影响. 生态学报, 2003, 23(4): 22-29.
[19]  李春格, 李晓鸣, 王敬国. 大豆连作对土体和根际微生物群落功能的影响. 生态学报, 2006, 26(4): 1145-1150.
[20]  于颖, 刘元英, 罗盛国. 重茬胁迫下硒对大豆叶绿体超微结构和叶片微量元素含量的影响. 应用生态学报, 2003, 14(4): 573-576.
[21]  韩晓增, 许艳丽. 大豆连作减产主要障碍因素的研究连作大豆土壤有害生物的障碍效应. 大豆科学, 1999, 18(1): 47-51.
[22]  牛秀群, 李金花, 张俊莲, 等. 甘肃省干旱灌区连作马铃薯根际土壤中镰刀菌的变化. 草业学报, 2011, 20(4): 236-243.
[23]  赵爽, 罗佳, 凌宁, 等. 基因宏阵列和荧光定量PCR方法对西瓜枯萎病害土壤中尖孢镰刀菌的快速检测和定量. 土壤学报, 2010, 47(4): 703-708.
[24]  邱广伟. 马铃薯黑痣病的发生与防治. 粮食作物, 2009, 6: 133-134.
[25]  李乾坤, 孙顺娣, 李敏权. 马铃薯立枯丝核菌的研究. 马铃薯杂志, 1998, 2(2): 79-85.
[26]  张天晓. Rhizactonia solani菌丝融合群的研究. 湖南师范学院学报, 1984, 2: 69-71.
[27]  陈延熙, 张敦华, 段霞渝, 等. 关于Rhizactonia solani菌丝融合分类和有性世代的研究. 植物病理学报, 1985, 15(3): 139-143.
[28]  王丽丽, 日孜旺古丽·苏皮, 李克梅, 等. 乌昌地区马铃薯真菌性病害种类及5种新记录. 新疆农业科学, 2011, 48(2): 266-270.
[29]  郑亚明, 骆勇, 周益林, 等. 实时荧光定量PCR在植物病害流行学中的应用. 植物保护, 2011, 37(4): 18-22.
[30]  胡丹丹, 顾金刚, 姜瑞波, 等. 定量RT-PCR及其在植物学研究中的应用. 植物营养与肥料学报, 2007, 13(3): 520-525.
[31]  Filion M, St-Arnaud M, Jabaji-Hare S. Quantification of Fusarium solani f. sp. phaseoli in mycorrhizalbean plants and surrounding mycorrhizosphere soi1 using real-time polymerasechain reaction and direct isolations on selective media. Phytopathology, 2003, 93(2): 229-235.
[32]  Lees A, Cullen D, Sullivan L, et al. Development of conventional and quantitative real-time PCR assays for the detection and identification of Rhizoctonia solani 3 in potato and soil. Plant Pathology, 2002, 51(3): 293-302.
[33]  李光伟, 刘和, 张峰, 等. 荧光定量PCR监测五氯酚对好氧颗粒污泥和活性污泥中氨氧化细菌数量的影响. 微生物学报, 2007, 47(1): 136-140.
[34]  周世宁. 现代微生物生物技术. 北京: 高等教育出版社, 2007.
[35]  李振高, 骆永明, 滕应. 土壤与环境微生物研究法. 北京: 科学出版社, 2008: 76.
[36]  Lee S B, Taylor J W. Isolation of DNA from fungal mycelia and single spores. PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications. New York: Academic Press, 1990.
[37]  Cheung I Y, Cheung N K. Quantitation of marrow disease in neuroblastoma by real-time reverse transcription-PCR. Clinical Cancer Research, 2001, 7: 1698-1705.
[38]  Gelmini S, Tricarico C, Vona G, et al. Real-time quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction(RT-PCR)for the measurement of prestate-specific antigen mRNA in the peripheral blood of patients with prostate carcinoma using the taqman detection system. Clinical Chemistry and Laboratory Medicine, 2001, 39: 385-391.
[39]  Cullen D, Lees A, Toth I, et al. Conventional PCR and real-time quantitative PCR detection of Helminthosporium solani in soil and on potato tubers. European Journal of Plant Pathology, 2001, 107(4): 387-398.
[40]  Cullen D, Lees A, Toth I, et al. Detection of Colletotrichum coccodes from soil and potato tubers by conventional and quantitative real-time PCR. Plant Pathology, 2002, 51(3): 281-292.
[41]  Van De Graaf P, Lees A, Cullen D, et al. Detection and quantification of Spongospora subterranea in soil, water and plant tissue samples using real-time PCR. European Journal of Plant Pathology, 2003, 109(6): 589-597.
[42]  Lees A, Sullivan L, Cullen D W, A quantitative polymerase chain reaction assay for the detection of Polyscytalum pustulans, the ause of skin spot disease of potato. Journal of Phytopathology, 2009, 157(3): 154-158.
[43]  Fiers M, Edel-Hermann V, Chatot C, et al. Potato soil-borne diseases: A review. Agronomy for Sustainable Development, 2012, 32: 93-132.
[44]  Jeger M, Hide G, Van Den Boogert P, et al. Pathology and control of soil-borne fungal pathogens of potato. Potato Research, 1996, 39: 437-469.
[45]  Mendes R, Kruijt M, de Bruijn I, et al. Deciphering the rhizosphere microbiome for disease-suppressive bacteria. Science, 2011, 332: 1097-1100.
[46]  Ippolito A, Schena L, Nigro F, et al. PCR based detection of Phytophthora, nicotianae from roots and soil of citrus plantsspp and P. Procrrding 5th Congress of the European Foundation for Plant Pathology, 2000: 158-160.

Full-Text

Contact Us

service@oalib.com

QQ:3279437679

WhatsApp +8615387084133