丹参功能基因组学研究Ⅳ.丹参乙烯应答因子(ERF)基因的分析

目的：获得丹参乙烯应答因子结合蛋白基因序列，并进行生物信息学分析和初步的表达特性研究。方法：利用cDNA芯片技术，从不同时期毛状根中获得目的基因。利用BLAST进行序列比对，ORFfinder寻找开放读码框，Prosite分析蛋白质的基本结构域。用半定量RT-PCR检测其在丹参组培苗根、茎、叶中的表达情况。结果：得到一个乙烯应答因子结合蛋白基因全长序列，全长952bp，具有一个699bp的开放读码框和87bp的5′非编码区、166bp的3′非编码区，推测的氨基酸序列中含有一个高度保守的AP2/ERFDNA结合域，GenBankEF667000，命名为SmERF。半定量RT-PCR表明，SmERF基因在丹参组培苗根、茎、叶中均有转录水平的表达，根中表达量高于茎和叶中的。结论：首次得到丹参乙烯应答因子结合蛋白基因，为其功能研究提供了基础。