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ISSN: 2333-9721
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园艺学报  2009 

利用基因组步行方法克隆柑橘黄龙病病原菌亚洲种序列

, PP. 493-500

Keywords: 柑橘,黄龙病,candidatusliberibactor,序列

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Abstract:

对ncbi基因库黄龙病亚洲种病原菌序列进行拼接,并根据拼接结果在rplkajl-rpobc,16s/23srrna和omp3个位点上设计引物,采用基因组步行方法,在其亚洲种3个位点上共获得了15168bp非冗余新序列,其中,在rplkajl-rpobc位点上5′端上游区和3′端下游区分别获得了3218和2653bp的非冗余新序列;在16s/23srrna位点上5′端上游区和3′端下游区分别延伸了1853和2459bp的新序列;在omp基因位点上分别获得了4014和971bp的新序列。序列分析表明在rplkajl-rpobc位点上的新序列包含2个新基因(suhb和sera);16s/23srrna位点新序列包含4个新基因(膜转运蛋白基因、细胞壁脱氢酶假基因、5srrna、trnamet),omp位点新序列包含6个新基因(rpsb、tsf、pyrh、frr、cdsa2、cds2)。这些新序列的获得为以pcr为基础的黄龙病相关研究提供了有用的参考依据。

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