基于est库的猕猴桃脂氧合酶基因家族成员的克隆

利用猕猴桃est库及相关生物信息学手段,从果肉组织克隆了lox基因家族成员6个,命名为adlox1-6。adlox1、adlox2、adlox3和adlox4为全长cdna,编码区长度分别为2739、2595、2739和2709bp,adlox5和adlox6为cdna片段,长度为1359和1557bp。猕猴桃adlox2和adlox5氨基酸序列同源性最高,约74%,而adlox3和adlox5仅为49%。生物信息学分析表明,adlox1、adlox3、adlox4和adlox6可能具有132lox活性,在n端含有额外约60个氨基酸残基,而adlox2和adlox5则属于92lox类型。猕猴adlox1与番茄tomloxd具有最高氨基酸序列同源性(约80%),adlox2和adlox5与tomloxa高度聚类,序列同源性分别为68%和75%,adlox4和adlox6与tomloxc的氨基酸序列同源性分别为62%和63%,adlox3与番茄lox基因序列同源性低于55%。