部分蔬菜cmv分离物cp基因的克隆及序列分析

对来自国内不同地区、不同蔬菜作物上的8个黄瓜花叶病毒分离物,采用一步法rt-pcr扩增得到cp基因全长片段,分别克隆到pmd-18t载体并测序。结果表明,本研究8个分离物的cp基因均为657个碱基,可编码218个氨基酸,它们之间的核苷酸序列同源性较高,达92.8%～99.1%;将它们与genbank中部分cmvcp基因序列比较,显示出与cmv亚组ⅰ株系的核苷酸序列同源性达90.7%～98.0%,而与亚组ⅱ株系的核苷酸序列同源性仅有75.8%～78.1%。因此,这8个分离物应归属于cmv亚组ⅰ。