西湖底泥中的反硝化型甲烷厌氧氧化菌的分子生物学检测

反硝化型甲烷厌氧氧化反应(Denitrifyinganaerobicmethaneoxidation,DAMO)是一种最新发现的生物反应,该反应能够偶联反硝化和甲烷的厌氧氧化.催化DAMO反应的微生物是NC10门中一种被命名为"CandidatusMethylomirabilisoxyfera"的细菌.本研究采用基因克隆文库技术考察了西湖淡水底泥中DAMO微生物的分布与种群多样性状况.16SrRNA基因系统发育分析表明,西湖底泥中存在NC10门细菌,与已知的M.oxyfera的16SrRNA基因相似度为93%~98%.DAMO微生物功能基因(pmoA)的系统发育分析进一步证实了西湖底泥中分布有此类微生物,与已知的M.oxyfera的pmoA基因相似度为86%~95%.实时定量PCR结果表明,西湖底泥中DAMO微生物的16SrRNA基因的拷贝数为2.15×105copies·g-1(以干重计).