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海洋与湖沼 2010
鲫鱼(Carassius auratus)slc7A8 基因分子特征及表达分析DOI: 10.11693/hyhz201006021021 Keywords: 鲫鱼,slc7A8cDNA,分子特征,slc7A8mRNA表达丰度 Abstract: 采用 RT-PCR 和 RACE 技术克隆鲫鱼 slc7A8 基因的全长 cDNA 序列, 对基因序列用生物软件对基因进行生物信息分析, 用 Real-time PCR 方法检测基因在组织中的 mRNA 表达丰度。结果表明, 鲫鱼 slc7A8cDNA 全长为 2709bp, 包含 195bp 的 5′UCR 序列, 921bp 的 3′UCR 序列, 1593bp 开放阅读框, 编码 530 个氨基酸序列; 鲫鱼与斑马鱼基因同源性和编码氨基酸同源性分别为 88.9%和95.5%, 而与其他动物分别在 70.1%—74.8%和 80.6%—82.1%之间; 预测编码蛋白的分子量为57719.84, 等电点为 4.8, 对其结构预测显示该蛋白具有与哺乳动物十分相似的 12 个螺旋跨膜结构, 跨膜区氨基酸高度保守, 不同动物间的同源性都在 92.2%以上; Real-time PCR 检测鲫鱼组织中的mRNA 表达丰度高低顺序为前肠、中肠、脑、后肠、肌肉、肾、鳃、心、肝脏。
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