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ISSN: 2333-9721
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Optimization of DNA extraction from active sludge
一种活性污泥总DNA提取方法的优化

Keywords: 活性污泥,DNA提取,16S,rDNA,PCR,OPSCI

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Abstract:

对3种活性污泥DNA提取方法——传统蛋白酶K-SDS-氯仿异戊醇法(CPSCI法)、液氮研磨法和脱腐处理法进行了对比,并针对CPSCI法从污泥量、保温时间、裂解方式及沉淀时间等4个方面进行了优化。结果表明,优化的蛋白酶K-氯仿-异戊醇法(OPSCI法)采用污泥量0.10 g、37℃静置10 min,加SDS常温旋涡振荡及异丙醇直接离心等条件可获得长度在23.1 kb左右的DNA,OD260nm/OD280nm为1.86,稀释10倍后即可进行16S rDNA PCR。该方法重复性好,提取得率高,纯度好,操作简便, 为常规实验室开展活性污泥微生物多样性研究提供了帮助。

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