Cloning and expression of the beta-agarase gene agaD02 from Agarivorans albus QM38
白色噬琼胶菌QM38β-琼胶酶基因agaD02 的克隆与表达

从白色噬琼胶菌(Agarivorans albus) QM38基因组中扩增到一段编码β-琼胶酶的DNA 序列, 命名为agaD02。序列相似性分析的结果表明, 基因agaD02 和弧菌Vibrio sp. JT0107 及Vibrio sp. PO-303的琼胶酶基因具有同源性, 其相似性程度分别为98.7%和97.4%, 而同GenBank 中的其他序列同源性很低。对此基因的序列进行了分析, 结果表明, 其开放阅读框长度为2 868 bp, 编码的蛋白质包含955 个氨基酸, 在蛋白数据库中的编号为ABM90422, 推测其分子质量为106 ku, 等电点为4.87。利用网上数据库资源和生物学软件对预测的琼胶酶蛋白序列进行了同源性分析和结构分析。设计两端含酶切位点的特定引物, 克隆agaD02 基因, 构建入表达载体pET24a(+), 转化大肠杆菌BL21(DE3), 转化后提取质粒进行酶切和电泳验证, 转化后的大肠杆菌经诱导可产生胞外琼胶酶。