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生态毒理学报 2010
Methods of Extraction Different Gene Types of Sediments and Water for PCR Amplification
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Abstract:
提出直接从环境河流底泥和表层水体中同时提取不同形态DNA(胞内、胞外、染色体和质粒DNA)的有效方法. 利用该方法提取了海河典型区域底泥的胞外DNA和胞内DNA及水体中细菌染色体DNA和质粒DNA. 结果表明,NaH2PO4提取的胞外DNA分子量大于1kb,提取率40%~72%,没有共提取胞内DNA. 胞内DNA 提取的分子量均大于23.1kb,细菌质粒DNA与染色体DNA同时分离. 16S rDNA与sul2扩增验证提取方法可靠性. 16S rDNA扩增结果显示所有胞外DNA呈阴性,胞内DNA呈阳性. 质粒DNA和染色体DNA的16S rDNA扩增显示,染色体DNA结果显阳性,质粒DNA呈阴性,sul2的结果相反.