%0 Journal Article
%T DNA聚合酶与引物/模板的相互作用对PCR效率的影响
%A 刘建平
%A 张俊威
%A 朱坚
%A 杨奇奇
%A 黄强
%J -
%D 2014
%R 10.13523/j.cb.20140502
%X PCR是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法，引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。传统的PCR引物设计软件基本上忽略了DNA聚合酶与引物/模板的亲和性对PCR效率的影响。为揭示DNA聚合酶与引物/模板的相互作用是否对PCR的效率有影响，通过构建Taq DNA 聚合酶与不同序列引物/模板DNA相互作用的三维结构模型，采用MM/GBSA方法计算复合物的结合自由能，以结合自由能为参数，为人血清白蛋白基因(Human Serum Albumin gene，HSA gene)和结核杆菌pyrF基因(Mycobacterium tuberculosis pyrF gene)设计了PCR引物。PCR实验结果表明，引物的PCR效率与结合自由能相关：引物与聚合酶的结合自由能越低，PCR实验的效率相对越高。这说明DNA聚合酶与引物/模板的相互作用对PCR效率有重要影响。因此，引物/模板DNA与聚合酶的结合自由能可以作为PCR引物设计的新参数
%K PCR
%K DNA聚合酶
%K 引物设计
%K 结合自由能
%K 分子建模
%U http://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/abstract/abstract5143.shtml