%0 Journal Article
%T 脱氮硫杆菌硫化合物载体SoxYZ蛋白的同源建模和结构分析
%A 孟志忠
%A 张晨晨
%A 李杉
%A 陆远芳
%A 陈新
%J -
%D 2015
%R 10.13523/j.cb.20150710
%X 脱氮硫杆菌(Thiobacillus denitrificans)中的Sox蛋白在硫代谢过程中起着至关重要的作用,硫化合物需先与硫氧化基因族(sox)编码的蛋白质SoxYZ二聚体共价连接后才能与其他酶发生相互作用。利用同源建模法构建硫化合物载体 SoxYZ蛋白的二聚体结构并验证了其合理性。二聚体相互作用分析发现SoxYZ蛋白的溶剂可及表面积(solvent accessible surface,SAS)为10 922.9 ？2, 疏水率为50.85%;亚基SoxY和SoxZ界面处共含有12个氢键和1个Π键来维持其三维结构的稳定性;二聚体表面呈现明显的正负电势互补,两亚基界面处氨基酸残基的VDW作用能和静电作用能分别为－80.925 13kcal/mol和－323.856 57kcal/mol,这说明静电作用是二聚体形成的主要驱动力;SoxZ亚基的残基Thr28、Arg31、Lys32、Ser64、Gly65、Val66、Ser67对SoxY亚基活性位点构象的稳定有重要作用
%K 脱氮硫杆菌
%K 二聚体
%K 同源建模
%K 蛋白质相互作用
%U http://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/abstract/abstract5608.shtml