%0 Journal Article
%T 雨生红球藻低覆盖度基因组草图分析 *
%A 刘亚铭
%A 秦松
%A 赵国屏
%A 郑华军
%A 陈军
%J -
%D 2018
%R 10.13523/j.cb.20180704
%X 开展雨生红球藻基因组测序研究,对于解读绿藻起源与进化及生物逆境胁迫响应机制,以及推动雨生红球藻产业发展都具有重要意义。利用Illumina Hiseq 2500对雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)进行高通量测序,获得低覆盖度全基因组草图。通过计算k-mer分布预测该基因组草图大小约为547Mb,GC含量为59.2%,为纯合或单倍体。共得到11 059个预测基因,平均基因长度为1 711bp,平均CDS长度为681bp;平均每个基因包含3.2个外显子,外显子的平均长度为353bp。代谢通路分析表明,具有完整的糖酵解、三羧酸循环、磷酸戊糖途径、嘌呤和嘧啶合成等基本代谢通路
%K 雨生红球藻
%K 基因组测序
%K 基因预测
%K 功能注释
%U http://manu60.magtech.com.cn/biotech/CN/abstract/abstract6238.shtml