%0 Journal Article
%T 水稻子预44和江南香糯基因组比较鉴定稻瘟病抗性相关基因
%A 李金璐 张慧焦泽宇 刘剑宇 韩光煜 卓晓轩 罗琼
%J 中国水稻科学
%D 2020
%R 10.16819/j.1001-7216.2020.9066
%X 摘要 【目的】子预44是一具有广谱持久稻瘟病抗性的云南地方粳稻品种。为了鉴定子预44中候选稻瘟病抗性相关基因，【方法】本研究利用高通量测序技术（High-throughput sequencing）对子预44和感病水稻江南香糯进行了全基因组测序。而后使用软件GATK(3.4-46)对高质量测序结果进行SNP和InDel的检测和统计，进一步筛选出子预44和江南香糯DNA水平存在SNPs/InDels多态性抗病相关基因。【结果】通过Hiseq X10 PE150平台分别获得了4 118 170 045 bp和2 995 054 509 bp子预44和江南香糯的基因组数据，比对到参考基因组（Ensembl release 31）的比对率分别为98.56％和98.30％。在抗病水稻子预44和感病水稻江南香糯之间鉴定了922个纯合突变的差异抗病相关基因。结合基因定位结果，在子预44中鉴定了一个新的抗稻瘟病候选基因。【结论】研究结果为子预44中抗稻瘟病新基因的克隆提供了参考，对子预44广谱持久抗瘟分子机制的研究奠定了基础
%K 水稻
%K 稻瘟病
%K 基因组测序
%K 抗病相关基因
%U http://www.ricesci.cn/CN/abstract/abstract2844.shtml