%0 Journal Article %T 中国北京汉族人群和日本东京人群ROR2基因单核苷酸多态性比较 %A 王红 %A 赵凯平 %J 中华流行病学杂志 %D 2011 %X 目的比较中国北京汉族人群(CHB)和日本东京人群(JPT)受体酪氨酸激酶样孤立受体2(ROR2)基因单核苷酸多态性(SNP)的异同。方法 收集国际人类基因组单体型图计划(HapMap)公布的CHB及JPT的ROR2基因SNP数据,利用Haploview和SPSS 13.0软件区分纯合与非纯合基因型SNP,以基因型测定率>80%、H-W平衡(P>0.01)、MAF>0.01且无性别差异(P>0.05)为标准,在非纯合基因型SNP中确定合格SNP;标签SNP根据r2≥0.8或对数优势比(LOD)≥3进行确定;并比较合 格SNP及标签SNP的MAF、单体域及单体型频率。结果 CHB和JPT的ROR2基因SNP在两人群中 名称相同且均为404个,其中纯合基因型SNP为101个。两人群共有257个名称相同的合格SNP,其中224个(87.2%) SNP在两人群中的微效等位基因亦相同。257个合格SNP在CHB和JPT中分别形成18和27个单体域,除2个为JPT独有外,其余单体域在两人群完全或部分重叠。两人 群中名称相同的标签SNP为50个,分别占CHB和JPT各自标签SNP的64.9%和70.4%。结论 通过分析HapMap数据可避免将纯合基因型SNP纳入遗传易感性研究,CHB和JPT的ROR2基因SNP及单体域特征以共性为主,与人群的地域和种族属性一致 %K 受体酪氨酸激酶样孤立受体2 %K 单核苷酸多态性 %U http://chinaepi.icdc.cn/zhlxbx/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20111123&flag=1