%0 Journal Article
%T 肠道病毒71型北京分离株全基因组序列分析
%A 何鹏
%A 周诚
%A 姚昕
%A 张卫
%A 李凤祥
%A 毛群颖
%A 王军志
%A 粱争论
%A 黄雏金
%J 中华流行病学杂志
%D 2009
%R 10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2009.07.022
%X 目的 了解2008年北京地区肠道病毒7l型(EV71)分离株的全基因序列特点。方法 收集北京地区手足口病患儿的咽拭子样本12份, 对其中l份样品08YM.3, 经Vero细胞分离培养, 提取病毒RNA。利用RT-PCR和5’、3’RACE扩增EV71全长基因。对PCR产物克隆和测序。利用DNAStar软件包的MegAlign进行核苷酸序列分析。构建系统进化树。结果 分离的EV71病毒株经过扩增后克隆得到3个涵盖EV71全基因组的阳性质粒。测序后拼接为EV71全基因组, 命名为BJ08株。BJ08的5’非编码区(UTR)、Pl、P2、P3、3’非编码区(UTR)和全基因组的核苷酸与亚型的参考序列f司源性均最高, 分别为95, 6％.96.7％、88.3％.96.1％、78.1％～94.0％、90.8％。94.6％、85.9％～94.1％和90.9％～93.9％。BJ08株与其他亚型各区段的核酸同源性均低于90％。在全基因序列与VPI区构建的系统进化树中, BJ08株均与“亚型在同一分支。BJ08株与“亚型参考株VPlⅨ的6个亚型相关氨基酸序列一致, VPI抗原性表位(92～107aa)无变异。结论 北京BJ08 EV71病毒分离株为C4业型
%K 肠道痫毒71型
%K 基因型
%K 手足口病
%U http://chinaepi.icdc.cn/zhlxbx/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20090722&flag=1