%0 Journal Article
%T 穗花杉的转录组测序及其转录组特性分析
%A 李论
%A 王帅
%A 芦强
%A 邱德有
%A 邵芬娟
%J 林业科学研究
%D 2017
%R 10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.05.008
%X [目的]通过对红豆杉科穗花杉属的穗花杉进行转录组测序，为穗花杉的萜类合成途径和分类学研究提供支持。[方法]利用HiSeq2500技术对穗花杉的茎叶进行转录组测序。[结果]穗花杉转录组测序共得到8.14 Gb的clean data。从头组装共获得82 884条unigene，其中有27 495条unigene被注释。此外，在82 884条unigene中共搜索到2 827个SSR位点，单核苷酸重复SSR出现频率最高（60.1%），其次为三核苷酸重复SSR（25.4%）。在穗花杉unigene中挖掘出了1个牦牛儿基焦磷酸合成酶（GPS）、1个法尼烯基焦磷酸合成酶（FPS）和5个牦牛儿基牦牛儿基焦磷酸合成酶（GGPS）的同源基因，同时得到紫杉二烯合成酶（TS）同源基因13个。[结论]发现了20个与萜类合成有关的unigene和2 827个SSR位点，为今后穗花杉萜类生物合成研究，特别是紫杉二烯合成酶编码基因的研究打下了基础，也为该物种系统分类地位及遗传多样性研究提供了新的遗传信息
%K 穗花杉 转录组 SSR 萜类合成基因 分类
%U http://www.lykxyj.com/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20170508&flag=1