%0 Journal Article
%T 基于EST序列的甘蔗SNP发掘及分析
%A 檀小辉
%A 张继
%A 梁芳
%A 金刚
%A 吕平
%A 韦丽君
%J 江苏农业科学
%D 2016
%X 从NCBI中的EST数据库下载已公布的甘蔗EST序列28 512条，利用DNAStar软件中的Seqman程序进行叠连群构建，EST序列共构建3 449个叠连群，从中筛选出93个叠连群，长度共计105 385 bp，发现候选SNP位点 1 449个，SNP平均出现频率为1.37%，共有74个contigs含有SNP位点，平均每个contig含有19.58个SNP位点，含有SNP位点数最多的1个叠连群有229个SNP候选位点，不同的叠连群含有的SNP位点数量差异较大，但转换类型与颠换类型所占比例很接近。本研究所用的叠连群的总长度是105 385 bp，平均72.93 bp含有1个SNP位点
%K 甘蔗
%K NCBI
%K EST序列
%K DNAStar
%K SNP位点
%U http://www.jsnykx.cn/oa/DArticle.aspx?type=view&id=201607017