%0 Journal Article %T HashESU:一种生物网络模体识别高效方法 %A 赵静 %A 钟诚 %J 中山大学学报(自然科学版) %D 2015 %X 摘要 通过模体识别可以获得生物网络结构和功能,生物网络模体识别过程涉及到子图枚举和子图同构的问题,计算量非常大.提出一种高效的网络模体识别算法HashESU,它使用经典算法ESU枚举子图,采用Hash表结构保存生成的子图,利用每个新增结点与已经确定的结点之间的关系,生成子图标识关键字SIK并映射到Hash表中,每个SIK只在第一次生成时才需要调用同构计算,以大大减少调用NAUTY算法进行同构检测的次数、更快地进行查找和插入子图操作,进而加快模体识别的速度.实验结果表明,在模体识别结果质量相同的前提下,HashESU算法的运行效率明显优于著名的ESU算法和使用四分树结构存储子图的QuateXelero算法. %K 生物网络 %K 模体识别 %K 子图枚举 %K 子图同构 %K Hashing %U http://xwxt.sict.ac.cn/CN/abstract/abstract3062.shtml