%0 Journal Article
%T 梁山慈竹体细胞突变体No.30的SLAF-seq特异分子标记分析<br>Specific Molecular Marker Analysis of the Somaclonal Mutant No.30 of <i>Dendrocalamus farinosus</i> through SLAF-seq
%A 王懋林
%A 胡尚连
%A 曹颍
%A 卢学琴
%A 徐刚
%A 黄艳
%A 龙志坚&lt
%A br&gt
%A WANG Mao-Lin
%A HU Shang-Lian
%A CAO Ying
%A LU Xue-Qin
%A XU Gang
%A HUANG Yan
%A LONG Zhi-Jian
%J 植物研究
%D 2017
%R 10.7525/j.issn.1673-5102.2017.04.016
%X 梁山慈竹体细胞突变体No.30具有纤维素含量高、木质素含量高、纤维细胞长度长、纤维细胞长宽比大等特点，但由于梁山慈竹主要进行无性繁殖，不易获得纯合植株，突变体No.30的分子水平鉴定一直无法进行，严重阻碍了该突变体的推广利用。对梁山慈竹体细胞突变体No.30进行特异分子标记分析，并初步确定其性状变异来源。本研究利用SLAF-seq技术分别对突变体No.30以及同地区野生型梁山慈竹群体（CK）的基因组进行了简化基因组测序。经过了测序、建库、多态位点开发、特异多态性位点筛选等过程，最后对特异多态性位点筛选结果进行注释分析。结果发现突变体No.30的GC含量、纯合InDel数低于野生型梁山慈竹，而检测到的InDel总数以及杂合InDel数却高于野生群体。对SLAF-seq得到的InDel、SNP位点进行特异性筛选，获得了突变体No.30中稳定存在的特异InDel/SNP标签，包括特异C-T转换9381个、特异A-G转换9472个、特异InDel 329个。通过对这些特异SLAF标签进行注释，发现有6个特异SNP标签和1个特异InDel与纤维素合成相关，3个特异SNP标签与木质素合成相关，以及4个特异SNP标签和1个特异InDel与纤维细胞形态建成有关。这些结果表明突变体No.30在体细胞培养的过程中在基因组水平上发生了突变，并初步确定了其性状变异来源。但这些特异SLAF标签与突变体No.30在纤维素含量和木质素含量，以及纤维细胞发育等性状方面的相关性仍需进一步验证。<br
%K 克隆植物
%K 突变体鉴定
%K 梁山慈竹
%K 体细胞无性系
%K SLAF-seq
%K &lt
%K br&gt
%K clonal plants
%K mutants identification
%K &lt
%K i&gt
%K Dendrocalamus farinosus&lt
%K /i&gt
%K somaclone
%K SLAF-seq
%U http://bbr.nefu.edu.cn/CN/abstract/abstract3601.shtml