%0 Journal Article
%T 基于转录组数据的杜仲红叶性状SSR分子标记分析<br>Analysis of Red Leaf Color SSR Molecular Markers by Transcriptome Sequencing of <em>Eucommia ulmoides</em>
%A 苗作云
%A 杨赟
%A 刘攀峰
%A 郑新芳
%A 杜红岩
%A 朱景乐&lt
%A br&gt
%A MIAO Zuo-Yun
%A YANG Yun
%A LIU Pan-Feng
%A ZHENG Xin-Fang
%A DU Hong-Yan
%A ZHU Jing-Le
%J 植物研究
%D 2017
%R 10.7525/j.issn.1673-5102.2017.06.013
%X 对‘华仲12号’杜仲的幼嫩叶片（绿色）和成熟叶片（红色）及‘华仲11号’杜仲成熟叶片（绿色）进行转录组测序，进行测序数据的拼接和组装，且对转录组获得的基因（Unigenes）进行SSR分析。研究得到54 517条平均长度为806.90 bp的Unigenes，其中25 993条Unigenes在Nr、Swiss-Prot、KEGG和COG蛋白数据库获得功能注释，占所有Unigenes的47.68%。参照KEGG数据库，可将注释到的6 910条Unigenes划分到122个代谢途径分支，其中花色苷代谢途径相关酶基因39个，类黄酮代谢途径38个，类胡萝卜素合成途径34个。54 517条Unigenes中共包含17 010个完整型SSR位点，占总SSR位点的96.28%。完整型SSR位点共包含67种重复基元，其中出现频率最高的重复基元类型为单核苷酸重复中的A/T （7 747个），其次是AG/CT （5 039个）和AT/AT （850个）从花色苷代谢途径、类黄酮代谢途径及类胡萝卜素代谢途径中共找到13个SSR位点。为今后杜仲遗传多样性分析、遗传图谱构建及杜仲红叶性状分子标记开发等方面奠定了分子基础。<br
%K 杜仲
%K 红叶
%K 微卫星
%K 转录组
%K 高通量测序
%K &lt
%K br&gt
%K &lt
%K em&gt
%K Eucommia ulmoides&lt
%K /em&gt
%K red leaf
%K microsatellites
%K transcriptome
%K high-throughput sequencing
%U http://bbr.nefu.edu.cn/CN/abstract/abstract3640.shtml