%0 Journal Article
%T 基于高通量测序分析青藏高原特有植物蓝玉簪龙胆(<em>Gentiana veitchiorum</em>)的SSR和SNP特征<br>Characteristics of SSR and SNP in <em>Gentiana veitchiorum</em> in Qinghai-Tibetan Plateau,by High-throughput Sequencing
%A 田尊哲
%A 高庆波
%A 陈世龙
%A 张发起&lt
%A br&gt
%A TIAN Zun-Zhe
%A GAO Qing-Bo
%A CHEN Shi-Long
%A ZHANG Fa-Qi
%J 植物研究
%D 2016
%R 10.7525/j.issn.1673-5102.2016.05.016
%X 利用Illumina HiSeqTM2500平台对青海省库泽县的蓝玉簪龙胆（Gentiana veitchiorum）进行高通量测序，共得到SSR序列8 588条，对其SSR重复类型进行分析；三核苷酸重复类型所占的比例最大占54.7%（4696）；其次是二核苷酸重复类型占41.3%（3543）；四核苷酸重复类型，五核苷酸重复类型和六核苷酸重复类型所占的比例较少（共占4%）。在二核苷酸重复类型中AT/TA重复类型所占的比例最大分别为9.85%和9.5%。在微卫星中重复单元的长度大小和重复次数成负相关，并且微卫星的总长度与重复单元的长度成正相关。在蓝玉簪龙胆的花（GP-F）和叶（GP-L）中分别得到253 789和249 417个SNP位点，其中在非编码区上的比例为51.29%和51.96%。分析发现蓝玉簪龙胆SNP位点在编码区中同义转换所占的比例（48.63%和47.96%）要远远高于非同义转换的比例（0.08%和0.08%），可能与功能基因序列相对稳定有关。<br
%K 蓝玉簪龙胆
%K 高通量测序
%K 微卫星
%K 单核苷酸多态性
%K 青藏高原
%K &lt
%K br&gt
%K &lt
%K em&gt
%K Gentiana veitchiorum&lt
%K /em&gt
%K next generation sequencing
%K SSR
%K SNP
%K Qinghai-Tibetan Plateau
%U http://bbr.nefu.edu.cn/CN/abstract/abstract3495.shtml