%0 Journal Article
%T 椭圆叶花锚简化基因组的SSR信息分析及SSR引物开发<br>Simplified Genome SSR Information and Development of SSR Primers of <em>Halenia ellipitica</em>(Gentianaceae)
%A 王久利
%A 陈世龙
%A 邢睿
%A 宋相杰
%A 朱明星
%A 张发起&lt
%A br&gt
%A WANG Jiu-Li
%A CHEN Shi-Long
%A XING Rui
%A SONG Xiang-Jie
%A ZHU Ming-Xing
%A ZHANG Fa-Qi
%J 植物研究
%D 2018
%R 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.02.018
%X 基于RAD-seq简化基因组测序技术获得椭圆叶花锚（Halenia ellipitica D.Don）简化基因组水平上的序列信息并开发SSR分子标记。利用SR search软件检测而得到双端各有至少100 bp的五种类型的SSR（二、三、四、五、六核苷酸）位点共6 201个，并成功设计其中3 865个SSR引物。在能成功设计引物的SSR位点中，三核苷酸SSR位点最多；重复序列长度包括17种（12~36 bp）；重复序列的基序共达316种，其中五核苷酸基序种类最多（91种）。从中挑选65对可对应五种SSR类型的引物，经梯度PCR检验后，利用椭圆叶花锚的4个居群32个个对可扩增的引物进行PCR和聚丙烯酰氨凝胶电泳检测，其中14对引物能在绝大多数个体中扩增，且13对具多态性。13个多态性位点的等位基因数量均值为5.462，多态性较高且不连锁（P<0.05）；其中10个位点在多数居群中偏离哈迪温伯格平衡（P<0.01）且存在较高的纯合子数量（观测杂合度Ho均值0.226）；近交系数在-0.443~1，均值为0.656；基因流Nm为0.474。<br
%K 椭圆叶花锚
%K RAD-seq
%K SSR分子标记
%K 简化基因组测序
%K &lt
%K br&gt
%K &lt
%K em&gt
%K Halenia ellipitica&lt
%K /em&gt
%K RAD-seq
%K SSR molecular marker
%K simplified genome sequencing
%U http://bbr.nefu.edu.cn/CN/abstract/abstract3685.shtml