%0 Journal Article %T 版纳微型猪近交系RNF4基因克隆、多组织qPCR表达及功能生物信息学分析 Cloning, muti-tissues qPCR expression and functional bioinformatics analysis of Banna mini-pig inbred line gene RNF4 %A 张霞 %A 曾日彬 %A 霍金龙 %A 王配 %A 陈园园 %A 王淑燕 %J 东北农业大学学报 %D 2017 %X RNF4基因调节精细胞分化和增殖过程,文章以Gen Bank下载的猪及近缘物种RNF4 mRNA序列为参考序列,设计特异引物扩增版纳微型猪近交系(BMI)RNF4基因。应用qPCR分析15个重要组织mRNA表达谱,并对蛋白质序列作功能生物信息学分析,构建多物种系统进化树。研究获得BMI RNF4 573 bp编码区序列(Gen Bank登录号:KU705638,对应氨基酸登录号:AOC89056),编码190个氨基酸,蛋白质分子质量(Mw)为21.43 ku,等电点(pI)为6.95。多组织荧光定量表达分析表明RNF4基因在尿道球腺、睾丸、肝、肺中高水平表达;在其他11个组织中呈中低水平表达。功能生物信息学分析表明RNF4蛋白质存在1个保守结构域,无跨膜结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端疏水;有4类功能活性位点,位于细胞核概率为94.1%。系统进化分析表明,BMI与狗亲缘关系最近。结果为研究RNF4基因在猪精细胞分化和增殖方面作用奠定基础。 %K RING指环 %K 版纳微型猪近交系 %K 组织表达 %K 生物信息学 %U http://dbdn.cbpt.cnki.net/WKD/WebPublication/paperDigest.aspx?paperID=753302c3-68d7-41c6-9cd8-05df5e5727ad