%0 Journal Article
%T 力达霉素产生菌球孢链霉菌c-1027中atra同源基因的克隆及分析
%A 李光伟
%A 王丽非
%A 王松梅
%A 洪斌
%J 中国生物工程杂志
%D 2010
%X 目的：在天蓝色链霉菌streptomycescoelicolora3(2)中多效性调节因子atra（atra-c）可通过激活放线紫红素途径特异性的调节因子actii-orf4的转录来控制放线紫红素的产生。在灰色链霉菌streptomycesgriseusnbrc13350和阿维链霉菌streptomycesavermitilisma-4680中也发现了atra-c编码基因（atra-c）的同源基因，分别影响链霉素和阿维菌素的生物合成。本文目的在于探索球孢链霉菌c-1027（streptomycesglobisporusc-1027）中是否存在atra，克隆球孢链霉菌c-1027中atra基因并进行生物信息学分析，为进一步确定其对力达霉素产生的调控作用及调控机制奠定基础。[方法]采用在球孢链霉菌c-1027中异源表达atra-c，来确定atra-c对力达霉素产量的影响；通过southernblot分析来判断在球孢链霉菌c-1027基因组中是否有atra-c同源基因；pcr扩增方法获得球孢链霉菌c-1027atra基因（atra-gl）并测序；通过多种生物信息学软件来分析atra-gl及其与旁侧基因的组织结构、对已发现的atra蛋白进行同源性比对及亲缘关系分析。[结果]在球孢链霉菌c-1027中异源表达天蓝色链霉菌atra-c蛋白，发现其对力达霉素的产量有影响。以atra-c为探针，通过southernblot分析显示球孢链霉菌c-1027基因组中存在atra-c的同源基因。pcr扩增得到球孢链霉菌c-1027的atra基因的全序列以及该基因上下游的旁侧序列（genbank/embl/ddbj登录号gu723707）。通过对球孢链霉菌c-1027、天蓝色链霉菌a3(2)、灰色链霉菌nbrc13350以及阿维链霉菌ma-4680atra蛋白序列进行同源性分析发现，四种atra蛋白编码氨基酸序列一致性达到65%至87%，相似性高达70%至89%。并且，球孢链霉菌c-1027atra基因与相邻基因形成的组织结构与天蓝色链霉菌和灰色链霉菌完全一致。根据蛋白质同源性绘制进化树，发现球孢链霉菌atra蛋白与灰色链霉菌atra蛋白亲缘关系最近。[结论]确定在球孢链霉菌c-1027中存在atra同源基因并影响力达霉素的产量，克隆了首个力达霉素生物合成基因簇外的调节基因——atra基因，通过生物信息学分析初步推测了该基因的功能，为进一步研究atra-gl对力达霉素途径特异性级联调控网络的调控关系奠定了基础。
%K 球孢链霉菌c-1027
%K atra调控基因
%K 力达霉素
%U http://159.226.100.150:8082/biotech/CN/abstract/abstract12415.shtml